凯撒不愿错过这个大好机会，当即命令已经组成行军队列的士兵们返回、重新开始列阵。可以说在交战之前凯撒一方的士兵们就多消耗了一些精力。
此时，交战双方：
庞培的总兵力约有五万人，他将部队分为左、中、右冀三部，右翼紧挨着埃尼培乌斯河，由兰图鲁斯统率；中路是主力部队，由梅特卢斯统率；左翼则由阿米提乌斯统率；在左翼的最外侧集中了六千四百名骑兵，由拉比埃努斯指挥。
庞培按照常规的三列阵线布阵，但是每一个大队的纵深都有十排，其深度远超一般情况，这样可以较长时间的抵御和牵制住凯撒精锐部队的猛烈进攻。
而他将取胜的关键集中在左翼外侧的庞大骑兵队伍身上，因为庞培的优势就在于骑兵数量远超凯撒，他想充分利用自己的这个优势，让骑兵在开阔平原上纵横驰骋，先击溃对方骑兵，再席卷敌阵。
庞培的战术简单明了，观察敌情的凯撒一望便知，于是他针对性的开始布阵。
凯撒的总兵力接近三万人（在前世历史中只有2.2万人），他也相对应的将部队分为左、中、右三部，左翼紧邻埃尼培乌斯河，由安东尼率领；中路由卡尔维努斯率领；右翼名义上归属小苏拉指挥，但实际上凯撒一直坐镇在其后方。
虽然同样也是传统的三列阵线列阵，但由于兵力少于对方，每个大队的纵深只有四至六列。在右翼的外侧同样也布置了骑兵，看起来似乎要凭此来抵挡庞培的骑兵，但实际上凯撒在右翼骑兵的后方秘密布置了十个步兵大队，呈斜形站立，由于前方骑兵的遮蔽和列阵时烟尘的弥漫，庞培一方没有发现凯撒的这个部署。
在战斗开始之前，凯撒还特地检阅了全军，诸多老兵和百夫长们纷纷表示：要为凯撒获取胜利，打完这最后的一仗！
士气高涨的士兵们在凯撒下达前进的命令后，就以稳健的步伐秩序井然的向前推进，在接近敌人后才发出呐喊、投掷标枪。
结果他们发现敌人并没有冲上来进行厮杀，而是站在原地没动。
于是，凯撒的士兵们表现出了令人生畏的高度纪律性，他们竟然停下脚步，在阵前冷静的重新调整队伍，才继续前进。到达合适位置后再次投出第二根标枪，然后呐喊着发起冲锋。
凯撒军队的猛烈冲锋导致庞培军阵前列出现混乱，但庞培军人多势众，纵深特别大，最终还是抵挡住了冲锋，使双方步兵陷入激烈的厮杀之中。
庞培虽然命令自己的步兵坚守阵地不动，但一开始他就让拉比埃努斯率领骑兵向数量处于劣势的对方骑兵发起冲锋。
凯撒骑兵迅速败退，引诱对方追击。
庞培的骑兵数量庞大，但他们是来自多个地区，相互之间缺乏默契的配合，而且统帅各支骑兵的大多数热情澎湃、但缺乏经验的罗马青年贵族。