秘密调查局虽然没有抓到什么有力人物，但山本一夫知道了天化组织有2个超级战士失踪，也立即派手下寻找。那天晚上唯一的线索就是警方接到远处邻居报案，说废弃工厂有爆炸声，没有听到枪声。但目暮警官带人调查后发现，爆炸不是炸弹之类的火药造成的，形成的破坏也不明显，认为是有人恶作剧，就收队了。其实千钧走时候，把那些战斗的痕迹全部抹去了，没有留下任何线索。秘密调查局后来也去了那里查看，同样一无所获，但他们还是猜到这里发生过战斗，但是哪个组织的人就判断不出来了。
帝丹小学，孩子们决定先去美术教室，步美落在后面，急忙追过去，走得时候却忘了关水龙头，后面出现个人影悄悄将水龙头关上了。侦探团先来到美术教室，元太要开灯，柯南急忙阻止，这样会被人发现的。柯南埋怨他们没有带手电筒，原来只有光彦带了。柯南发现石膏上的确有记号，石膏像头部也有胶带痕迹。随后，侦探团来到保健室，却没有看到人体模型。步美掀开了帷幕，发现了后面的恐怖模型。惊骇之下，步美惊叫着逃走了，四处乱跑。柯南3人只好急忙跑出去追她。
慌张之下，步美撞到了一个箱子上，跌坐在地上。柯南等人过来，步美在地上找手帕。元太发现箱子里都是玩偶娃娃，唐僧玩偶上写着步美的姓吉田，然后沙悟净是圆谷，八戒是小岛，江户川的是悟空。元太有些不满，结果玩偶的头断裂了，掉在地上。元太吓坏了，跌坐在地上。光彦怀疑破裂的玩偶与学生的减少有关，元太吓得满头大汗，“接下来消失的人不会是我吧？”光彦只好安慰他，“我随口乱说的。”光彦猛然发现人体模型出现在对面保健室前面的走廊里，吓得大叫起来。