当时吕布大声喊道：“助纣为虐的，都是李儒！谁能把他擒住？”李肃应声愿意前往。忽然听到朝门外传来呼喊声，有人报告说李儒的家奴已经把李儒捆绑起来献了上来。王允命令把李儒押到集市斩首；又将董卓的尸首在大街上示众。董卓身体肥胖，看守尸首的军士把火放在他的肚脐中当作灯，油脂流了满地。百姓路过，没有不向他的头扔东西，用脚践踏他尸首的。王允又命令吕布同皇甫嵩、李肃率领五万兵马，到郿坞抄没董卓的家产和人口。
李傕、郭汜、张济、樊稠听说董卓已死，吕布即将到来，便率领飞熊军连夜逃奔凉州。吕布到了郿坞，先找到了貂蝉。皇甫嵩命令把坞中所藏的良家子女全部释放。只要是董卓的亲属，不论老幼，全部诛杀。董卓的母亲也被杀害。董卓的弟弟董旻、侄子董璜都被斩首示众。抄没坞中所积蓄的财物，黄金有数十万，白银有数百万，绫罗绸缎、珠宝、器皿、粮食，不计其数。这些情况回报给王允。王允于是大肆犒赏军士，在都堂设宴，召集众官，饮酒庆贺。
正在饮宴之时，忽然有人报告说：“董卓的尸体暴露在集市上，忽然有一个人趴在他的尸体上大哭。”王允发怒说：“董卓被诛杀，士民没有不称贺的；这个人是谁，竟敢独自哭泣！”于是呼唤武士：“给我把他抓来！”不一会儿，人被抓到。众官一看，无不惊骇：原来这个人不是别人，正是侍中蔡邕。王允叱责说：“董卓是逆贼，如今被诛杀，这是国家的大幸。你身为汉朝臣子，却不为国家庆贺，反而为贼哭泣，这是为什么？”蔡邕认罪说：“我虽然没有才能，也知道大义，怎么会背叛国家而向着董卓呢？只是因为一时受到他的知遇之恩，不自觉地为他哭了一场，自己知道罪大。希望您能原谅我：倘若能对我施以黥刑、砍掉双脚，让我继续完成汉史，来赎我的罪过，那就是我的万幸了。”众官爱惜蔡邕的才华，都极力营救他。太傅马日磾也私下对王允说：“伯喈是旷世奇才，如果让他继续完成汉史，实在是一件盛事。而且他的孝行一向显著，如果仓促杀了他，恐怕会失去人心。”王允说：“昔日汉武帝不杀司马迁，后来让他作史，结果导致诽谤之书流传后世。如今国运衰微，朝政错乱，不能让奸佞之臣在幼主身边执笔，使我们遭受他的诽谤议论。”马日磾无言而退，私下对众官说：“王允恐怕要断子绝孙了吧！善人，是国家的纲纪；著史，是国家的典章。毁灭纲纪，废弃典章，怎么能长久呢？”当时王允不听马日磾的话，命令把蔡邕关进狱中绞死。一时间，士大夫们听到这个消息，都为之流泪。后人评论蔡邕哭董卓，固然不对；王允杀他，也太过分了。有诗感叹道：“董卓专权肆不仁，侍中何自竟亡身？当时诸葛隆中卧，安肯轻身事乱臣。”
且说李傕、郭汜、张济、樊稠逃到陕西，派人到长安上表请求赦免。王允说：“董卓的跋扈，都是这四个人帮助的结果；如今即使大赦天下，唯独不能赦免这四个人。”使者回去报告李傕。李傕说：“请求赦免不成，我们各自逃命吧。”谋士贾诩说：“诸位如果抛弃军队单独行动，那么一个亭长就能把你们抓住。不如引诱召集陕西人以及本部军马，杀进长安为董卓报仇。如果事情成功，就尊奉朝廷来匡正天下；如果不能取胜，再逃走也不迟。”李傕等人觉得他说得对，于是在西凉州散布流言说：“王允打算杀光这里的人！”众人都惊恐不安。他们又扬言说：“白白送死没有好处，能跟我一起吗造1反？”众人都愿意跟随。于是聚集了十多万人，分成四路，杀向长安。路上遇到董卓的女婿中郎将牛辅，率领五千人马，正要去为丈人报仇，李傕便与他合兵，让他作为先锋。四人陆续进发。
王允得知西凉兵来了，与吕布商议。吕布说：“司徒放心。这些鼠辈，何足挂齿！”于是率领李肃出兵迎敌。李肃当先迎战，正好与牛辅相遇，双方大战一场。牛辅抵挡不住，败阵而逃。没想到当夜二更，牛辅趁李肃不备，竟然前来劫寨。李肃的军队四处逃窜，败走了三十多里，折损了大半人马，回来见吕布。吕布大怒说：“你为何挫伤我的锐气！”于是斩杀了李肃，将他的头悬挂在军门。第二天，吕布进兵与牛辅对敌。牛辅哪里是吕布的对手，仍然大败而逃。当夜，牛辅叫来心腹人胡赤儿商议说：“吕布骁勇无比，我们万万不能抵挡；不如瞒着李傕等四人，暗藏金银珠宝，和三五个亲随抛弃军队逃走。”胡赤儿答应了。当夜收拾好金银珠宝，弃营而逃，跟随的有三四个人。将要渡过一条河时，胡赤儿想要谋取金银珠宝，竟然杀死了牛辅，带着他的头来献给吕布。吕布问清缘由，跟随的人告发说：“胡赤儿谋杀牛辅，抢夺他的金宝。”吕布发怒，立即将胡赤儿诛杀。吕布领军前进，正好遇到李傕的军马。吕布不等他们列阵，便挺戟跃马，指挥军队直冲过去。李傕的军队抵挡不住，退走了五十多里，依山扎营。李傕请郭汜、张济、樊稠一起商议说：“吕布虽然勇猛，然而没有谋略，不足为虑。我领军守住谷口，每天引诱他厮杀，郭将军可以领军抄袭他的后路，效仿彭越骚扰楚军的方法，鸣金就进兵，擂鼓就收兵。张、樊二位将军，则分兵两路，直接攻打长安。他首尾不能救应，必然大败。”众人采用了他的计策。
吕布率领军队到了山下，李傕领军挑战。吕布愤怒地冲杀过去，李傕退上山去。山上箭石如雨，吕布的军队无法前进。忽然报告说郭汜在阵后杀来，吕布急忙回战。只听到鼓声大震，郭汜的军队又退走了。吕布刚要收军，锣声响起，李傕的军队又杀来了。还没来得及对敌，背后郭汜又领军杀到。等到吕布赶来，却又擂鼓收军退去了。这激得吕布怒气填胸。一连几天都是如此，想战不能战，想停不能停。正在恼怒之时，忽然飞马报来，说张济、樊稠两路军马，竟然进犯长安，京城危急。吕布急忙领军回救，背后李傕、郭汜追杀过来。吕布无心恋战，只顾奔走，折损了不少人马。等到了长安城下，贼兵像乌云聚集、大雨倾盆一样，将城池团团围住，吕布的军队与贼兵交战不利。军士们畏惧吕布的残暴严厉，很多人投降了贼兵，吕布心中十分忧虑。
几天之后，董卓的余党李蒙、王方在城中作为贼兵的内应，偷偷打开城门，四路贼军一起涌入。吕布左冲右突，拦挡不住，带领数百骑兵前往青琐门外，呼喊王允说：“形势危急了！请司徒上马，一同出关，再另想良策。”王允说：“如果承蒙社稷的神灵保佑，能够安定国家，这是我的心愿；如果不能如愿，那么我就舍身赴死。临难苟且偷生，我不会这样做。替我向关东诸公致谢，让他们努力以国家为重！”吕布再三劝说，王允只是不肯离开。不一会儿，各门火焰冲天，吕布只得抛弃家小，带领一百多骑兵飞奔出关，投奔袁术去了。
李傕、郭汜放纵士兵大肆抢掠。太常卿种拂、太仆鲁馗、大鸿胪周奂、城门校尉崔烈、越骑校尉王颀都死于国难。贼兵紧紧围绕内庭，侍臣请天子登上宣平门制止骚乱。李傕等人望见黄盖，约束住军士，口呼“万岁”。献帝倚着楼栏问道：“你们不等待奏请，就擅自进入长安，想要做什么？”李傕、郭汜仰起头上奏说：“董太师是陛下社稷的臣子，无端被王允谋杀，我们特地来报仇，不敢造1反。只要见到王允，我们就退兵。”王允当时在皇帝身边，听到这话，上奏说：“我本是为了社稷着想。事已至此，陛下不能顾惜我，而耽误国家。我请求下去会见这两个贼子。”皇帝犹豫不决，不忍心。王允从宣平门楼上跳了下去，大声呼喊：“王允在这里！”李傕、郭汜拔剑叱责说：“董太师有什么罪而被杀害？”王允说：“董贼的罪行，漫天盖地，说也说不完！他被诛杀的那天，长安的士民都相互庆贺，你们难道没听说吗？”李傕、郭汜说：“太师有罪；我们有什么罪，不肯赦免我们？”王允大骂：“逆贼何必多言！我王允今日只有一死而已！”两个贼子手起刀落，将王允杀死在楼下。史官有诗称赞道：“王允运机筹，奸臣董卓休。心怀家国恨，眉锁庙堂忧。英气连霄汉，忠诚贯斗牛。至今魂与魄，犹绕凤凰楼。”
众贼杀了王允，一面又派人将王允的宗族老幼全部杀害。士民无不落泪。当时李傕、郭汜寻思道：“既然已经到了这里，不杀掉天子图谋大事，更待何时？”于是手持宝剑，大声呼喊，杀进内宫。正是：巨魁伏罪灾方息，从贼纵横祸又来。